Các tính năng và chi tiết chính:
Các mẫu đất là môi trường phức tạp được đặc trưng bởi sự hiện diện của các hợp chất ức chế, chẳng hạn như axit humic, kim loại nặng và các thành phần thơm khác có thể gây khó khăn cho các phân tích tiếp theo.
Bạn quan tâm và muốn thử nó? Liên hệ ngay với chúng tôi!
Hotline hỗ trợ: 028 38 688 284 (028) 38 688 283
Mẫu đất là môi trường phức tạp được đặc trưng bởi sự hiện diện của các hợp chất ức chế, chẳng hạn như axit humic, kim loại nặng và các thành phần khác có tính thơm mạnh, có thể gây khó khăn cho các phân tích hậu xử lý. SPINeasy DNA Pro Kit for Soil đã được thiết kế cẩn thận để phân lập DNA genom vi sinh vật thuần khiết từ các loại đất khó như những loại có sinh khối thấp hoặc bị ô nhiễm nặng. SPINeasy DNA Pro Kit for Soil hiệu quả trong việc lyse các quần thể vi sinh vật khác nhau, bao gồm vi khuẩn, nấm, virus và ký sinh trùng. Bộ kit cung cấp các sản phẩm tương tự như FastDNA ™ SPIN Kit của chúng tôi nhưng có độ tinh khiết cải thiện và thời gian xử lý giảm xuống. Các sản phẩm DNA cô lập không có ức chế trong PCR và sẵn sàng được sử dụng cho các ứng dụng hậu xử lý, bao gồm PCR đoạn dài, qPCR và công nghệ thế hệ tiếp theo (16S và toàn bộ gen) mà không cần thêm bước loại bỏ chất ức chế.
Kit performance
Hình 1. Chất lượng DNA. Mẫu đất với nồng độ sinh khối/ chất gây ô nhiễm khác nhau (250mg mỗi mẫu) đã được xử lý bằng SPINeasy DNA Pro Kit for Soil hoặc bộ kit cạnh tranh. Nhóm sinh khối trung bình bao gồm các mẫu được lưu trữ ở nhiệt độ -20°C trong 12-24 tháng có thể ảnh hưởng tiêu cực đến năng suất và tính nguyên vẹn của DNA được tách ra. Năng suất và độ tinh khiết DNA (tỷ lệ A260/280 và A260/230) đã được đánh giá bằng máy phổ quang trong bốn lần khi các mẫu nằm trong phạm vi phát hiện. Mỗi chấm trên đồ thị biểu diễn một quá trình chiết xuất đơn lẻ. Thanh ngang chỉ ra giá trị trung vị. Tính nguyên vẹn của DNA đã được đánh giá bằng gel DNA. Đối với các mẫu có sinh khối thấp, tỷ lệ DNA cùng lượng được tải lên để so sánh hiệu suất của SPINeasy DNA Pro Kit for Soil và bộ kit cạnh tranh (Q pro).
Hình 2. Khả năng tăng trưởng. Sự vắng mặt của chất ức chế được đánh giá bằng phản ứng PCR nhạy cảm với mẫu không pha loãng cũng như PCR định lượng. Phân tích vi sinh vật 16s. Vùng siêu biến V4 của gene RNA ribosome 16S của vi khuẩn được tăng cường bằng cách sử dụng DNA được chiết xuất từ mẫu đất có sinh khối cao bằng 4 bộ kit chiết xuất được mô tả trong chú thích. Các chuỗi được thu được bằng nền tảng NovaSeq PE250 và được phân tích bằng đường ống Qiime 2. Tỷ lệ phần trăm của các loài vi khuẩn được biên soạn từ 3 lặp kỹ thuật được hiển thị bên trái. Tỷ lệ phần trăm cho thấy tỷ lệ trung bình của gram dương firmicutes (màu vàng) được tìm thấy trong các mẫu DNA được thu được từ cùng một mẫu đất. Đường cong hiếm hoi tương ứng với mỗi phương pháp được miêu tả bên phải. Đa dạng alpha được đo bằng số đơn vị phân loại hoạt động (OTUs) được xác định (trục đứng) sau sâu xác định (trục ngang) trong quá trình đo lường đa dạng.
Ghi chú ứng dụng
SPINeasy DNA Pro Kit for Soil ly giải hiệu quả các quần thể vi sinh vật khác nhau như vi khuẩn, nấm, vi rút, sinh vật nguyên sinh. Bộ này cung cấp năng suất tương tự như bộ FastDNA™ SPIN Kit được đánh giá cao của chúng tôi, nhưng với độ tinh khiết được cải thiện và giảm thời gian xử lý. DNA tách biệt cho thấy không có sự ức chế trong PCR và ngay lập tức sẵn sàng được sử dụng cho các ứng dụng tiếp theo, bao gồm PCR đoạn dài, qPCR và giải trình tự thế hệ tiếp theo (16S và toàn bộ bộ gen) mà không cần thêm bước loại bỏ chất ức chế
Tuyên bố sử dụng
Chỉ sử dụng cho nghiên cứu (RUO).
Ứng dụng chính
Bộ gen, Sinh học phân tử, Phân lập và tinh chế axit nucleic, PCR, qPCR, Giải trình tự (NGS)
Bạn quan tâm và muốn thử nó? Liên hệ ngay với chúng tôi!
Hotline hỗ trợ: 028 38 688 284 (028) 38 688 283
| SKU | 116546050 |
| Application Notes | The SPINeasy DNA Pro Kit for Soil effectively lyses various microbiome population such as bacteria, fungi, viruses, protists. The kit provides similar yields to that of our highly cited FastDNA™ SPIN Kit, but with improved purity and reduced processing time. Isolated DNA showed no inhibition in PCR and was immediately ready to be used for downstream applications, including long fragment PCR, qPCR, and next-generation sequencing (16S and whole genome) without the need of further inhibitor removal step |
| Base Catalog Number | 65460 |
| Components | 50xLysing Matrix YB, 2ml RNase A Solution, 55ml Buffer S1, 22ml Buffer S2, 50ml Buffer S3, 28ml Buffer S4, 40ml Buffer S5, 6ml Buffer S6, 50x Column S, 50x 2ml collection tubes, 50x 1.5ml collection tubes |
| Hazard Statements | Hazard Class 8 |
| Pack Size | 50 Preps |
| Personal Protective Equipment | Safety Goggles/Faceshield; Gloves |
| Storage | Store at Room Temperature (15-25℃), Dry environment |
| Usage Statement | Research Use Only (RUO). |
